Manual de usuario

PROYECTO GENOMA
BERKELEY DROSOPHILA





INTRODUCCIÓN

El presente documento tiene por finalidad ser una herramienta de apoyo para el uso de la página sobre EL PROYECTO DEL GENOMA BERKELEY DROSOPHILA que se ha diseñado para conocer la información acerca de este proyecto.

El Berkeley Drosophila Genome Project (BDGP) es un consorcio de la Drosophila Genome Center, financiado por la National Human Genome Research Institute, Instituto Nacional del Cáncer, y Howard Hughes Medical Institute, a través de su labor de apoyo a las Gerald Rubin, Allan Spradling, Roger Hoskins, Hugo Bellen, Susan Celniker, y Gary Karpen laboratorios.

Los objetivos del Centro de Genoma Drosophila son para terminar la secuencia del genoma euchromatic de Drosophila melanogaster a la alta calidad y de generar y mantener las anotaciones biológicas de esta secuencia. In addition to genomic sequencing, the BDGP is 1) producing gene disruptions using P element-mediated mutagenesis on a scale unprecedented in metazoans; 2) characterizing the sequence and expression of cDNAs; and 3) developing informatics tools that support the experimental process, identify features of DNA sequence, and allow us to present up-to-date information about the annotated sequence to the research community.

El acceso a este proyecto se encuentra disponible en la pagina http://www.fruitfly.org/.

FUNCIONALIDADES DE LA APLICACIÓN

Acceso al Proyecto Genoma Berkeley Drosopila

Para acceder al Proyecto Genoma Berkeley Drosophila se deberá utilizar un navegador Web como Microsoft Internet Explorer, http://www.fruitfly.org/.

Inicio

En la figura nº1 podemos ver la imagen principal de la pagina http://www.fruitfly.org/. Cuando ingresamos en ella.

Figura nº1

Figura nº2

En la figura nº2 encontramos el nombre de la base de datos el cual es Proyecto Genoma Berkeley Drosophila, igualmente el titulo Inicio; en el cual encontramos el link BDGP NOTICIAS, dando clic sobre el link podemos ingresar a las noticias mas recientes acerca del Proyecto Genoma Berkeley Drosophila.

Figura nº3

• Permite ingresar dando clic sobre cualquier link que encontramos allí acerca de BDGP para así saber de que trata cada proyecto

En la figura nº3 encontramos el titulo Proyectos; dividido en 16 link los cuales son referentes a los trabajos que se han diseñado o están en ejecución por parte de la pagina u algunos autores colaboradores del PROYECTO GENOMA BERKELEY DROSOPHILA, podemos ingresar a estos dando clic para saber de lo que trata cada proyecto.

Figura nº4

Permite ingresar dando clic sobre cualquier link que encontramos allí acerca de BDGP para así poder saber de que trata cada recurso.


En la figura nº4 encontramos el titulo Recursos; conformado por 4 link, los Recursos son utilizados en tareas como descargar secuencias de aminoácidos o base de datos que se encuentran en distintos formatos como FASTA, al igual materiales de búsqueda o información, publicaciones entre otras. Relacionados con BDGP.

Figura nº5

Permite ingresar dando clic sobre cualquier link que encontramos allí acerca de BDGP para así poder saber de que trata cada herramienta.

En la figura nº5 encontramos el titulo herramientas de software; en el cual encontramos 2 link mediante los cuales encontramos materiales informáticos como los software diseñados para la simulación de procesos, la implementación de tareas y la recolección de muestras. Herramientas de software implementadas sobre el PROYECTO GENOMA BERKELEY DROSOPHILA.

Figura nº6

Permite realizar búsquedas acerca del proyecto BDGP desde google.

En la figura nº6 encontramos el titulo Buscar sitio BDGP; buscador de Google para realizar búsquedas cualesquiera que sea desde esta pagina.

Figura nº7

Permite ir a la base de datos de FlyBase , donde podemos consultar diferentes datos, por ejemplo especie, datos de la clase, buscar por medio de un ID, código o nombre.

En la figura nº7 encontramos el titulo Ir a FlyBase; donde podemos consultar diferentes datos, por ejemplo especie, datos de la clase, buscar por medio de un ID, código o nombre.

Figura nº8

Nos suministra la información de los contactos directos o que están relacionados con el desarrollo del proyecto. Como los directores y sus aportes, la gente que esta involucrada en los proyectos y personal en general.

Sirve como guía para ampliar el buen uso de las herramientas, es decir, brinda la información adecuada de cómo se debe citar los datos o publicaciones requeridas. Según su fecha, autor, tema y las referencias correctamente especificadas del BDGP.

BIOINFORMATICA I INGENIERIA DE SISTEMAS IV

UN PROBLEMA MAS, GRACIAS A LA DESINFORMACION HUMANA

NOMBRE: Valinaácido L-2-aminoisovaleriánico

SÍMBOLOS: Val; V

FAMILIA: aminoácidos con sustituyentes no polares (hidrofóbicos) (2/7)

FÓRMULA MOLECULAR: C5H11O2N

MASA MOLECULAR: 117

¿Porque la dieta sirve? muchos de los aminoácidos que el cuerpo necesita solo se obtienen atreves de la dieta. Y la consciencia humana.

Su organismo funciona como lo alimente. Si consume alimentos que le proporcionen grandes beneficios como son la producción de energía, el buen funcionamiento circular, nervioso y la producción de hormonas, estará sano, sin embargo personas no consientes intelectual o moralmente, optan por alimentar su organismo con la conocida comida “chatarra”, pobre en nutrientes necesarios por el cuerpo humano, para el desarrollo de actividades digestivas, y formativas en cuestiones de salud para el organismo.

Sin avisarle exageradamente en la actualidad se conocen 20 aminoácidos que su organismo puede asimilar, de los cuales 8 de ellos solo logran sintetizarse mediante la dieta, encontrados estos en su mayoría en alimentos con altos índices proteicos, entre los mas comunes casos están los deportistas, consecuencias como la mala digestión, la perdida de masa muscular entre otras, son factores obedientes a las dietas inadecuadas o el exceso del consumo proteico necesario para el organismo.

Mostrando así los desordenes que pueden afectar la potencia, calidad muscular y hasta la misma salud en miles de personas en el mundo. Consumidores que utilizan en su vivir diario medicamentos fraudulentos, que prometen ilusamente mejorar la resistencia de los tejidos, y la tonificación muscular. Para así obtener la figura soñada por muchos. No lejos de esta ilusión se esconden los tratamientos y suplementos a bases de aminoácidos esenciales, negocio sucio pero que puede ser efectivo para algunos, y la desgracia para otros.

· La Valina es una de los aminoácidos esenciales que necesita el organismo.

Para entender un poco más sobre los suplementos se debe tener muy conocimiento de los aminoácidos mencionados. Los aminoácidos son monómeros de las proteínas, están formados por carbono, hidrogeno, nitrógeno y oxigeno. Existen aminoácidos no esenciales conocidos así porque suelen fabricarse de otros aminoácidos, los esenciales son aminoácidos básicos y son originados de las proteínas de la dieta.

Conociendo así algunos aspectos fundamentales de los aminoácidos, y la relación existente entre la síntesis de proteínas, para producir efectos segundarios indispensables para el organismo, hablaremos de la valina como el aminoácido importante para el crecimiento del cuerpo.

La Valina es una de los aminoácidos esenciales que necesita el organismo, la ingesta recomendada por la OMS (organización mundial de la salud), oscila entre 10 mg/kg por kilo de peso, sin olvidar que el metabolismo de los aminoácidos esta muy ligados al metabolismo total de el organismo. La Valina es obtenido por hidrólisis de proteínas y regula el sistema nervioso y digestivo previniendo desordenes futuros.

Razón por cual se han creado suplementos con aminoácidos utilizados durante la dieta, especialmente en los deportistas para recuperar la actividad física, gastada en competencia o el entrenamiento, sin embargo, el uso indebido, y las cantidades exageradas de aminoácidos que se le ingresen al organismo, pueden generar errores o alteraciones fatales que pueden causar desde enfermedades severas, hasta la perdida de peso sin control.

· Valina es una cadena ramificada de aminoácidos.

Valina (Abreviado Val o V) aminoácido formulado químicamente HO 2 CCH (NH 2) CH (CH 3) 2, Sus codones son GUU, GUC, GUA y GUG. It is named after the plant valerian . Es el nombre de la planta de valeriana. Tiene una estructura tan similar a la leucina e isoleucina, que incluso se ha comprobado que en ocasiones se reemplazan entre sí en determinadas posiciones. Junto con leucina y isoleucina, pertenece a un cadena ramificada de aminoácidos , es decir, un compuesto que tiene una condición abierta que no es lineal, de esta se emplean periódicamente tratamientos a pacientes que han sufrido quemaduras, así como en la suplementos dietéticos de los atletas que practican musculación.

Aislada por primera vez por el señor Emil Hermann Fischer (1852-1919), químico y premio Nobel alemán, que realizó importantes aportaciones al estudio de los azúcares en 1901. Fue el numero uno en efectuar la hidrólisis de las proteínas complejas en aminoácidos. Y recibió en 1902 el premio nobel de química por sus trabajos.

·El consumo de alimentos constituidos por la Valina ayudan en desordenes

Podemos encontrar fuentes de Valina en alimentos como: el arroz y otros cereales, las lentejas, el pollo, las habas de riñón, otras legumbres, las nueces de acajú, y los melocotones, las gallinas o aves de corral y al igual la leche, son alimentos en los que podemos encontrar Valina. Un estudio reciente sobre nutrición revela que el consumo de alimentos constituidos por la Valina, ayudan en desordenes musculares, problemas nerviosos, y hasta el insomnio metal y emocional de las personas.

Además del control de desordenes, la Valina es un estimulante que ayuda en la reparación del tejido y el balance de nitrógeno en el organismo, gracias a ser un cadena ramificada es utilizada como fuente de energía, y al tener esta función puede preservar aun mas la utilización de la glucosa en el cuerpo. Muchos de los aminoácidos esenciales como la Valina, son utilizados en la prevención de la adicción a las drogas, y en tratamientos para cancelar el consumo de alcohol y el daño cerebral, así como enfermedades relacionadas con neurologías degenerativas.

· Desventajas de la Valina en el organismo

En cuestiones de salud el organismo es sensible a cambios inescrupulosos, y sensible a diversos factores nutricionales. Tabúes como el consumo de fruta no engorda, las papas engordan, los alimentos integrales adelgazan, el agua engorda, el marisco aumenta el colesterol, y las grasas reducen el nivel de leptina en la sangre, son miles de las razones por la que las personas se abstienen al consumo de algunos alimentos, y al cambio de su dieta diaria, creando una pregunta clara, ¿será que en el futuro habrá alimentos a la carta que actuaran en el metabolismo?

Pregunta que cada persona deberá responder, o esperar que marque una pauta en el tipo alimentación que ejerce hasta ahora, sin embrago, hay muchos mitos que es mejor echárselos a la boca y pasar la pagina, volviendo a la Valina se encuentran algunos problemas de salud que se expresan cuando se exagera su consumo, o cuando hace falta en el cuerpo, es decir, sus desventajas, enfermedades como la (MSUD) Orina de jarabe de arce, es causada por la incapacidad de metabolizar algunos aminoácidos como la Valina, llamada así porque la orina de los afectados huele al jarabe de arce.

A fecha de hoy la genética ha dado conocimiento de muchas más alteraciones de la Valina en el organismo, algunas como la intoxicación por su gran consumo, el origen a sensaciones extrañas en la piel, las alucinaciones, entre otras. Además es suministrada al igual para restablecimiento de la masa muscular tras cirugías y lesiones, es necesario llevar a cabo un estudio más riguroso de los aminoácidos ingresados al organismo, para evitar que el alto índice de proteínas puedan llegar a convertirse en grasa, y no en lo esperado.

Deficiencias en la Valina pueden afectar a la mielina que cubre los nervios, la adaptación de aminoácidos de cadena ramificada, pueden ayudar a prevenir desgarres a quienes hayan sufrido golpes, muchos de los suplementos a los que recurren las personas en grandes cantidades, son provenientes en su mayoría de origen animal. La Valina es considerada el aminoácido de cadena ramificada que capta el celebro, sin embargo se debe tener un equilibrio en las concentraciones de los aminoácidos para evitar la mala función hepática.

· Jugar con los posibles aminoácidos útiles para el desarrollo humano, y su metabolismo.

En la actualidad muchas personas quieren lucir una figura atlética, o simplemente se busca seguir una profesión deportiva, dependen del hecho de administrar o jugar con los posibles aminoácidos útiles para el desarrollo humano, y su metabolismo. Expertos en el tema plantearon que la solución al problema seria la modificación, o cambio de ambiente en la que la persona vive, al igual que los hábitos alimenticios que llevaba hasta el día que quiso modificar la nutrición, y la estimulación del ejercicio en su cuerpo.

Muchos de los estudios señalados, advierten sobre el mal uso y la mala alimentación que el ser humano utilice, con el fin de conseguir el cuerpo deseado, olvidando las mínimas normas de nutrición. Esto sin criticar el caso de las elecciones personales, como la estancia de las personas vegetarianas, no es entendible vegetariano(a), como la persona que conlleva una dieta balanceada, sino una forma de vida escogida, sin embargo hay investigaciones que advierten sobre los peligros nutricionales que pueden causar, una dieta o alimentación exclusivamente con vegetales.

Más que escapar de la obesidad, y de conseguir una figura perfecta y atlética, se debe buscar un equilibrio nutricional y metal, y es ahí donde no es nada fácil la tarea. El hecho de concienciar a la gente de que hay que comer menos y moverse más, y economizar dinero en suplementos innecesarios para el cuerpo y el bolsillo. No es un ejercicio fácil. En este sentido la bioinformtica seria de gran importancia, pues mediante una búsqueda significativa de herramientas científicas, se pueda llegar a establecer medicamentos, o formas naturales para el óptimo rendimiento del metabolismo humano, evitando alteraciones y posibles enfermedades ligadas al mal uso de los aminoácidos en nuestro organismo.


Referencias bibliograficas

· Los aminoácidos en el desarrollo físico .MARTHA LUSTRILLO COBOS, ING. BIOQUÍMICO.Escuela Nacional de Ciencias Biológicas. Instituto Politécnico Nacional

· Dr. Gustavo F. Gonzáles Rengifo y Dr. Arturo Villena
Instituto de Investigaciones de la Altura y Departamento de
Ciencias Biológicas y Fisiológicas Universidad Peruana Cayetano Heredia - Lima, Perú.

· Rodríguez-Sotres, Rogelio. La estructura de las proteínas.
· Leninhger Principios de bioquímica, Omega, Barcelona, 2000.
· Pato Pino Bioquímica II, Alfa, Buenos Aires, 2008.